七彩虹桥的光芒尚未完全消散，星枢台突然迸发刺目的警报强光，新嵌入的原初之种表面泛起细密的裂纹。远方天际，那艘刻满未知符号的方舟正撕裂云层缓缓逼近，船体周围环绕着闪烁着幽蓝光芒的能量环，每一道光环都在扭曲着空间，所过之处，星辰的轨迹都发生了诡异的偏移。
“这股能量...既不是混沌，也不是秩序！”陆离的虚影变得前所未有的凝实，鎏金软剑上浮现出警戒的纹路，“方舟的力量来自更遥远的维度，像是某种...宇宙的‘规则补全者’。”话音未落，方舟突然投射出一道棱镜状光束，触及地面的瞬间，整片森林开始逆向生长——参天古树化作幼苗，河流逆流而上，连空气中飘散的尘埃都停滞在半空。
肖家十二堂主勉强稳住身形，他们的生肖令牌竟开始吸收周围扭曲的时空能量，表面浮现出与方舟符号相似的暗纹。肖鼠堂主惊恐地发现，自己的影子正在脱离身体，化作黑色流体飘向方舟：“这些符号在剥离我们的存在痕迹！”凤珠立即挥动权杖，三色光芒与棱镜光束相撞，在虚空中炸出无数时空碎片。
碎片中，凤珠窥见了方舟的记忆残片：在宇宙诞生之初，存在着维持万物平衡的“初始法则”，但随着混沌与秩序的碰撞，法则逐渐残缺。这艘方舟正是为了“修正”失衡的宇宙而生，它的使命，是将所有偏离初始法则的文明...彻底抹除。
“原来我们的平衡，在它眼中竟是错误！”黑袍人残识突然在凤珠意识中剧烈震荡，“方舟的‘修正’不是拯救，而是毁灭！”此时，方舟船体轰然裂开，数以千计的棱形机械体蜂拥而出，它们的外壳流转着琉璃般的光泽，却蕴含着足以分解物质的高频震荡波。
一枚棱形机械体掠过星枢台，原初之种的裂纹瞬间扩大。凤珠咬牙将自身血脉与众生之力注入种子，光芒中浮现出大陆各族的身影，他们的双手交叠，在虚空中凝聚成对抗方舟的巨盾。然而，方舟核心突然升起一座发光的祭坛，祭坛上悬浮着一颗与原初之种极为相似的“法则核心”，它散发出的威压，竟让凤珠体内的混沌与秩序之力开始相互排斥。
“不能让法则核心与原初之种共鸣！”苗疆圣女的灵火在危机中化作锁链，缠住即将失控的凤珠。千钧一发之际，陆离的虚影突然化作实体，挥剑斩向法则核心。剑刃触及核心的刹那，陆离的身体开始透明化：“这是...宇宙规则的反噬！凤珠，你必须找到方舟的‘漏洞’...”
在陆离消散的光芒中，凤珠突然想起方舟记忆里一闪而过的画面——初始法则并非绝对完美，它也曾因过度追求秩序而产生裂痕。她握紧权杖，将“遗憾”的包容之力注入原初之种：“没有一成不变的规则，也不该有注定被抹杀的文明！”原初之种爆发出的光芒中，赫然浮现出方舟未曾记录的“变数”——那是万千生命在混沌与秩序中挣扎求生、不断变革的力量。
而在方舟内部，法则核心表面出现了第一道裂痕，同时响起了冰冷的机械音：“检测到未知变量，启动最终净化协议......”